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  • dxy_akaimzc4
    dxy_akaimzc4  发布了新帖 直肠癌转移肝癌环状RNA文章,影响因子高达7.8分 38天前

    文章导读: 在非编码RNA的大家族中,环状RNA是近年来继microRNA和lncRNA之后又一个明星成员。因其3’-5’端成环,所以在生物体中具有稳定性高,不易被降解的特性。大部分环状RNA通过直接或间接调控miRNA和靶基因参与海绵机制,现已有多篇文章报道该机制在疾病的发生发展过程中起至关重要的作用。另外,环状RNA在疾病组织中通常差异性表达,因此,十分适合做为癌症的分子标志物来研究。目前关于直肠癌转移肝癌领域还没有相关报道。本文通过环状RNA测序手段,对比直肠癌患者(CRC)与直肠癌转移为肝癌患者(CRC-m)组织样本,成功构建了国内首个直肠癌转移为肝癌的环状RNA表达谱。通过扩大样本量,证实两个差异上调的环状RNA,分别为circRNA_0001178和circRNA_0000826

  • dxy_akaimzc4
    dxy_akaimzc4  回复了帖子 吉西他滨耐药胰腺导管癌环状RNA文章 38天前
    欢迎新人,在丁香园可以学到好多东西,你可以了解到好多医学工作者。
  • dxy_akaimzc4
    dxy_akaimzc4  发布了新帖 吉西他滨耐药胰腺导管癌环状RNA文章 38天前

    文章导读:本篇文章主要研究的药物是吉西他滨,其主要应用于晚期胰腺癌病人的治疗,可是若病人对此类药物产生了耐药反应,那势必会影响患者的生活质量,甚至生命。目前,对于吉西他滨对胰腺癌耐药机制研究尚不明朗。作者首先构建了对吉西他滨耐药细胞系,并通过全转录组测序比较了耐药与正常细胞系之间环状RNA的表达谱。通过生信分析,快速找到10条感兴趣且差异表达的环状RNA,验证结果与测序结果一致。选取两条在吉西他滨耐药患者中显著高表达的环状RNA,在40例临床血浆样本中进行验证,发现两者表达模式不变。环状RNA和miRNA网络图显示两者可能结合的miRNA。沉默及过表达实验证实这些环状RNA可能影响吉西他滨耐药细胞系的功能。总的来说,本篇文章提供了一种研究吉西他滨耐药新的分子标志物。期刊:frontiers

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  • dxy_akaimzc4
    dxy_akaimzc4  发布了新帖 教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究 43天前

    文章导读:       禽白血病病毒J亚群(ALV-J)属于逆转录病毒属,慢病毒亚科的家族成员,可引起禽类多种肿瘤性疾病,如骨髓细胞瘤、肉瘤、血管瘤、肾肿瘤和成红细胞增多症,以及禽类骨髓白血病,导致受感染鸡的高死亡很率。该分散的ALV-J菌株分布广泛,既能水平传播又能垂直传播,往往造成禽类养殖领域的巨大经济损失。目前我们对ALV-J诱导的肿瘤发生机制仍不清楚,导致根除ALV-J带来的损害仍然是一项重大挑战。       近日,云序客户华南农业大学的谢青梅研究团队利用云序生物提供的环状RNA测序、、RIP和RNA pull down等技术手段首次揭示了感染了逆转录病毒ALV-J的家禽鸡显著上调的circ-Vav3通

  • dxy_akaimzc4
    dxy_akaimzc4  回复了帖子 环状RNA研究领跑者 50天前
    二、云序生物农口环状RNA文章:       人、大鼠、小鼠来源的环状研究已经取得了一定进展,农学背景的云序客户也在自己擅长的生物标本中进行了环状RNA研究,证明了环状在多个物种当中都起到了重要的生物学作用。河南农业大学研究团队首次提出环状分子可以调控小麦在环境压力下对光合作用、卟啉、叶绿素代谢、氧化磷酸化以及氨基酸的生物合成等方面起到应答性的调控作用,天津医科大研究团队在快速心房起搏(rapid atrial pacing,RAP)犬模型的心房组织中探寻circRNA-miRNA网络,预测环状分子在离子通道活性和细胞骨架结构成分中起重要作用。莠去津(Atrazine, AZ)是一种环境内分泌干扰物,可以影响两栖动物发育过程。山东职业卫生研究中心研究团队通过比较
  • dxy_akaimzc4
    dxy_akaimzc4  发布了新帖 环状RNA研究领跑者 50天前

           环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品,严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章,受到了广大客户的一致好评。迄今为止,云序已经积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病,客户发表文章达20篇以上,“云序制造”越来越多的出现在科研论文当中。       自2013年的两篇在Nature期刊上对于环状机制研究成果问世以来,对于环状RNA的关注达到了空前的地步,迅速成为RNA领域最火热的明星分子之一。环状RNA相比于线性结构的mRNA分子,具有更稳定的环状封闭结构,因此在循环体系中环状的表达量更

  • dxy_akaimzc4
    dxy_akaimzc4  发布了新帖 chip-seq 51天前

    核小体是由DNA和组蛋白形成的染色质基本结构单位,每个核小体由147bp的DNA缠绕组蛋白八聚体近两圈形成。ChIP:研究蛋白与DNA的结合染色质免疫沉淀技术(ChromatinImmunoprecipitation,简称ChIP)是研究体内蛋白质与DNA相互作用的一种技术。它利用抗原抗体反应的特异性,可以真实地反映体内蛋白因子与基因组DNA结合的状况.云序生物提供 1、IP + 测序 的完整解决方案2、优化的ChIP流程3、严格的质控4、专业的数据分析(包括富集峰识别、富集峰注释、富集峰统计、DEP的GO分析和Pathway分析、特定区域信号分布、富集峰可视化、motif分析。

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    dxy_akaimzc4  发布了新帖 RNA-pull down实验 52天前

     RNA 的下拉实验主要检测已知RNA相互作用蛋白质/RNA,我们主要提供的服务有RNA pull down——测序 / qPCR 和RNA pull down——MS / WB。RNA pull down利用生物素标记的RNA探针,与细胞提取液孵育。形成RNA-蛋白质/RNA复合物,通过磁珠把目的RNA拉下来,进而检测与之结合的RNA或蛋白质。质谱鉴定未知蛋白质,WB鉴定已知蛋白质,测序鉴定未知RNA基因,qPCR验证已知RNA基因。

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    dxy_akaimzc4  发布了新帖 25岁以后还可以整牙吗? 56天前

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    dxy_akaimzc4  发布了新帖 RIP-RNA免疫共沉淀技术 57天前

    RIP解决的是检测已知蛋白质与RNA的相互作用。用针对目标蛋白的抗体把相应的蛋白-RNA复合物沉淀下来,然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行测序分析。

  • dxy_akaimzc4
    dxy_akaimzc4  发布了新帖 最新国自然热点-RNA甲基化高分文章 57天前

        RNA甲基化研究现状主要包括三个方面m6A RNA甲基化,m5C RNA甲基化,m1A RNA甲基化.  下图是近七年RNA甲基化相关国自然立项情况。

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    dxy_akaimzc4  回复了帖子 某大公司不给完整检测结果,怎么办,求支招 57天前
    应该是实验没有做完,或者没做出来,而且大的公司本来售后或者服务就做的一般。不是科研能力要求很高的实验,可以交给把顾客当上帝的小公司。
  • dxy_akaimzc4
    dxy_akaimzc4  回复了帖子 一次测序,两项成果,影响因子合计10分! 57天前
    多谢版主经常关注,全转录组测序一个样本,环状,lnc,mRNA的数据都有,一个样本4000-5000之间。
  • dxy_akaimzc4
    dxy_akaimzc4  回复了帖子 某大公司不给完整检测结果,怎么办,求支招 57天前
    应该是实验没有做完,或者没做出来,而且大的公司本来售后或者服务就做的一般。不是科研能力要求很高的实验,可以交给把顾客当上帝的小公司。
  • dxy_akaimzc4
    dxy_akaimzc4  回复了帖子 求推荐靠谱的一代基因测序公司 57天前
    现在一般的一代测序都很成熟,比较好做。你找的话可以主要考虑价格和售后分析。推荐上海云序。
  • dxy_akaimzc4
    dxy_akaimzc4  回复了帖子 一次测序,两项成果,影响因子合计10分! 59天前
    欢迎大家咨询相关实验方案,搜索公司官网,更多了解公司。
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    dxy_akaimzc4  发布了新帖 一次测序,两项成果,影响因子合计10分! 59天前

    近日,中国医学科学院放射医学研究所的刘强团队研究揭示了lncRNAs在小鼠空肠辐射后表达的变化,为研究lncRNAs在辐射致肠损伤中的作用提供了靶分子。该研究成果以“Analysis of changes to lncRNAs and their target mRNAs in murine jejunum after radiation treatment”为题发表在《J Cell Mol Med》(IF: 4.302)。如果您刚巧看过这篇文章,并且关注了我们前期公众号(云序生物课堂)的话,您一定会有种似曾相识的感觉,没错!前不久,该研究团队就通过同样的测序数据发表circRNAs表达谱的文章 (Identification of Circular RNAs Altered in Mous

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    dxy_akaimzc4  发布了新帖 一次测序,两项成果 65天前

    前言:      又传喜讯!近日,云序客户中国医学科学院放射医学研究所的刘强团队研究揭示了lncRNAs在小鼠空肠辐射后表达的变化,为研究lncRNAs在辐射致肠损伤中的作用提供了靶分子。该研究成果以“Analysis of changes to lncRNAs and their target mRNAs in murine jejunum after radiation treatment”为题发表在《J Cell Mol Med》(IF: 4.302)。如果您刚巧看过这篇文章,并且关注了我们前期公众号的话,您一定会有种似曾相识的感觉,没错!前不久,该研究团队就通过同样的测序数据发表circRNAs表达谱的文章 (Identification of Circ

  • dxy_akaimzc4
    dxy_akaimzc4  发布了新帖 Y染色体上LncRNA TTTY15促进前列腺癌细胞的增殖和迁移 65天前

              前列腺癌(Prostate cancer,PCa)作为男性发病率第二的癌症,严重影响了患者生殖健康和生活质量。由于前列腺癌受多种基因调控,且目前缺乏相关机制方面的深入研究,治疗效果往往不甚理想。随着高通量技术的发展,使研究PCa相关分子标志物基因和作用机制成为可能。目前,已有报道指出许多明星LncRNA,如SChLAP1,HOTAIR,PCA3,PCAT1,NEAT1和CTBP1-AS在PCa中发挥着重要作用。那么问题来了,这些LncRNA多位于常染色体上,可PCa作为男性特有的疾病,那调控其功能的主要基因是否应该位于Y染色体上呢?        带着这

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