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  • SCI狂人团队
    SCI狂人团队  发布了新帖 生信数据挖掘文章可以发在那些期刊呢? 12天前

    最近有很多人问我们,生信数据挖掘的文章可以发在那些期刊?为了解答这个问题,我们写了这篇推文。我们总结了一些期刊的影响因子,审稿周期,是否要版面费,接受率,以供大家参考。期刊:MOLECULAR MEDICINE REPORTS影响因子:1.69是否要收版面费:否录用比例:大约66.25%审稿周期:大约平均1.6个月期刊:INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR MEDICINE影响因子:2.341是否要收版面费:否录用比例:大约77.85%审稿周期:大约平均2个月期刊:International Journal of Genomics影响因子:2.402是否要收版面费:是录用比例:不清楚审稿周期:不清楚期刊:GENE影响因子:2.415是否要收版面费:否录用比例:

  • SCI狂人团队
    SCI狂人团队  发布了新帖 GEO数据挖掘的深度不够?Oncomine数据挖掘不会选题?看这里 13天前

    最近有问我,感觉GEO数据挖掘的深度不够,有没有提高GEO数据挖掘的深度的方法呢?还有就是我们学会了Oncomine,但是不知道怎么样找目标基因,有没有方法呢?答案是有的,那就是将GEO联合Oncomine数据挖掘,既能提高GEO数据挖掘的深度,又能为Oncomine选题。所以在这里分享一个写作套路。写作套路:本文为本人原创,禁止转载。注意:这里只分享写作套路,具体的细节需要自己摸索。

  • SCI狂人团队
    SCI狂人团队  发布了新帖 Oncomine数据挖掘快速发文套路 23天前

    今天,给大家分享一篇文献,看看人家是怎么样利用Oncomine快速搞出一篇SCI的。文章题目:Expression and prognosis analyses of the Tob/BTG antiproliferative (APRO) protein family in human cancers具体分析步骤:1利用Oncomine分析APRO家族在多种癌症中mRNA的表达水平2利用Oncomine分析APRO家族在乳腺癌中mRNA的表达水平和预后价值3利用Oncomine分析APRO家族在肺癌中mRNA的表达水平和预后价值4利用Oncomine分析APRO家族在前列腺癌中mRNA的表达水平和预后价值5利用Oncomine分析APRO家族在结直肠癌中mRNA的表达水平和预后价值6利用O

  • SCI狂人团队
    SCI狂人团队  发布了新帖 不用脚本,如何轻松获取TCGA临床数据? 29天前

    之前,看见很多人在***,或者一些论坛求助脚本来提取生存时间,有些人有了脚本,但是不知道提取那个文件了。因此,今天分享一下如何不用脚本就能轻松获取TCGA临床数据。TCGA没有改版之前,生存时间等信息主要整合在metadata文件,可是metadata是json文件,看上去完全是一堆乱码,不懂编程根本就无法获取相关的数据。面对这种json文件,对于不会写脚本的人来说,的确很头疼,但是在2018年TCGA又进行了改版,TCGA将临床数据放在单独的文件,这种数据有两种格式,一种是TSV,一种是JSON。有些人参加过TCGA的课程,课程教他们直接下载JSON文件,然后用Perl脚本提取生存时间,但是改版后,有人说这些脚本提取不了,会报错,但是自己又不懂编程,所以就到处求助。对于不会编程的朋友,我们

  • SCI狂人团队
    SCI狂人团队  回复了帖子 meta分析无异质性而明显偏倚? 30天前
    发表偏倚是meta 的一部分,不能缺少
  • SCI狂人团队
    SCI狂人团队  的帖子被加了1分 33天前

    除了GEO、TCGA、Oncomine、SEER,还有别的数据库可以挖掘吗

    除了GEO、TCGA、Oncomine、SEER,还有别的数据库可以挖掘吗?当然是有的。那是什么数据库?可以做数据挖掘的数据库还有很多,我们这里要介绍的是GDSC数据库。第一、GDSC是什么?药物敏感性基因组学项目(GDSC)是Wellcome Sanger研究院(英国)的癌症基...
  • SCI狂人团队
    SCI狂人团队  发布了新帖 除了GEO、TCGA、Oncomine、SEER,还有别的数据库可以挖掘吗 34天前

    除了GEO、TCGA、Oncomine、SEER,还有别的数据库可以挖掘吗?当然是有的。那是什么数据库?可以做数据挖掘的数据库还有很多,我们这里要介绍的是GDSC数据库。第一、GDSC是什么?药物敏感性基因组学项目(GDSC)是Wellcome Sanger研究院(英国)的癌症基因组项目和马萨诸塞州综合医院癌症中心(美国)分子治疗中心之间的Wellcome资助的合作项目的一部分。 这项合作将两个地点的专业知识结合起来,以确定癌症生物标志物的目标,这些生物标志物可用于鉴定最可能对癌症治疗作出反应的基因定义的患者亚群。二、GDSC有什么?GDSC具有大于1000种抗癌治疗药物的基因特征人类癌症细胞系, 这些化合物包括细胞毒性化疗药物以及来自商业来源的靶向治疗药物,学术合作者以及生物技术和制药工业

  • SCI狂人团队
    SCI狂人团队  发布了新帖 GEO、TCGA、Oncomine,我应该选择哪一个? 44天前

    现在是大数据时代,数据越来越多了,数据库也越来越多了,各种各样的基因芯片数据库、蛋白质数据库。。。没完没了。面对如此多的数据库,我们不知挖那一个了。本来东西越来越多是好事情,但是却不知道怎么样选择?真是令人头痛呀!最近有很多人问我们,GEO、TCGA、Oncomine,我应该选择哪一个?哪一个比较简单?哪一个比较好文章、哪一个能发高分文章?哪一个不用学编程?哪一个容易上手?因此,我们面对这些问题做一些总结。1GEO数据库GEO是当今最大、最全面的公共基因表达数据资源。适合研究方向:基本包括所有疾病,不是做肿瘤的小伙伴可以选这个。难易程度:数据下载,整理都比较简单,分析过程需要R编程,这里有点难度,总的来说难度一般。发文的高度:只做纯GEO数据挖掘的文章一般只能1-2分的文章,文章的分数偏低。

  • SCI狂人团队
    SCI狂人团队  回复了帖子 Oncomine数据挖掘写作思路 45天前
    具体的分析请私聊我
  • SCI狂人团队
    SCI狂人团队  发布了新帖 Oncomine数据挖掘写作思路 47天前

    有一天,师弟问师兄,师兄完成一篇SC内容分析I的需要多长时间呀?师兄:我要看做什么类型了,下面我总结一下:做meta分析要两个星期做TCGA数据挖掘要一个星期做GEO数据挖掘要一天做Oncomine数据挖掘只要30分钟但是做老板的实验要四年。。。师弟:师兄为什么Oncomine数据挖掘这么快的?师兄:因为它不用编程,只要在鼠标点几下就可以了。师弟:我不信。师兄:那我展示给你看一下。第一步,查看目标基因在那些癌症中高表达?(5分钟)第二步,证明目标基因在某一肿瘤中是高表达的。(10分钟)第三步,寻找共表达的基因。(5分钟)第四步,确定目标基因在细胞系中是否高表达(5分钟)第五歩,基因表达与生存的相关性(5分钟)师兄:师弟,这下你信了吗师弟:这下真的信了。师兄:要是我能像你这样做这些数据挖掘,我

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