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  • Ritchie_Y
    Ritchie_Y  回复了帖子 16S测序鉴定细菌的几个问题 61天前
    谢谢。请问我想在一次提取的DNA里面测很多种细菌可以用一代测序不呢?我也看那些高通量的测序一般都是用来宏基因测序来研究环境中的微生物多样性,但是我并不想看细菌的多样性,只想看看那个环境中有多少和我研究领域相关的细菌是不是不用采用高通量的测序呢?
  • Ritchie_Y
    Ritchie_Y  发布了新帖 16S测序鉴定细菌的几个问题 67天前

    我想用测序的方法检测一下口腔细菌,刚接触这方面有一些疑惑:1. 一代测序和高通量测序在鉴定的结果上面有没有差异啊?主要是想着尽量在获得较好结果下少用一些钱。2. 要想尽量根据测序结果做出“种”级别的结果仅根据16S rRNA gene的某个或者某几个区设计引物够不够,还是要测16S全序列啊?3. 我看到的文献里面裂解细胞的方法主要是 溶酶法 和 bead beating 两种,请问两种方法哪一种更适合呢,或者说他们两的优缺点。问题挺多,非常感谢解答。

  • Ritchie_Y
    Ritchie_Y  回复了帖子 求助:目前国际研究通常用什么方法确定细菌类型啊? 75天前
    我是想做口腔细菌的测定,那要扩增哪几个区呢?这样一个样本用16s高通量测的话需要好多钱啊,如果再加分析又是多少钱呢?另外我看文献里有些人怎么用个specific的引物就算把菌测出来了呢,可不可靠哦?(原谅我问这么多,刚入门就是一头雾水,哭唧唧)
  • Ritchie_Y
    Ritchie_Y  发布了新帖 求助:目前国际研究通常用什么方法确定细菌类型啊? 76天前

    刚刚接触到细菌,最近在看文献写实验方案。举个类似的例子:假如我想测胸水中有没有肠道细菌(假如自己事先不知道胸水中有没有细菌,同时也不知道到底可能有哪几种肠道细菌),这一步实验就只是想确定胸水中是否有与肠道相关的细菌,国际上通用的做法是什么呀?测序能够达到要求吗,比如说16S,如果能,后续还需要做什么分析吗?我看有说测不到种,还需要做免疫生化吗?刚接触这方面,确实还不懂,希望各位解惑一下,谢谢。

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