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丁香客

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  • 麦特绘谱
    麦特绘谱  回复了帖子 投稿时communication 是干什么用的? 318天前
    你是不是理解错了,应该是选其中一种吧。Communication短小精悍,paper就要写的比较详细
  • 麦特绘谱
    麦特绘谱  发布了新帖 肠道菌群相关代谢物--短链脂肪酸生物学功能 318天前

    已有越来越多的研究针对饮食、微生物和生理学之间相互作用展开研究,本文将重点关注膳食纤维的微生物发酵产物短链脂肪酸(SCFAs)的生物学功能。SCFAs主要由乙酸盐、丙酸盐和丁酸盐组成,在调节宿主代谢、免疫系统和细胞增殖方面具有关键作用。SCFAs在盲肠和近端结肠中浓度最高,是结肠细胞能量来源(尤其是丁酸盐),也可以通过门静脉转运到外周循环中作用于肝脏和外周组织。尽管外周循环中SCFAs水平较低,但它们作为信号分子参与宿主不同的生物过程。微生物发酵产物:短链脂肪酸在肠道前端,膳食纤维不被宿主消化酶进行分解代谢,而进入盲肠和结肠部位,该部位的微生物群将膳食纤维发酵代谢产生SCFAs,以乙酸盐、丙酸盐和丁酸盐为主。然而,当可发酵纤维供不应求时,微生物转向对生长不太有利的能量来源,如来自膳食的氨基酸

  • 麦特绘谱
    麦特绘谱  回复了帖子 血清轻微溶血对代谢组学测量影响大不大? 324天前
    影响挺大的,红细胞破裂会释放大量代谢物出来,有相关文献报道的。
  • 麦特绘谱
    麦特绘谱  回复了帖子 代谢组学 364天前
    可以用UPLC-QqQMS,UPLC-QE, UPLC-QTOF,LCMS太笼统了,前面三个你都可以叫它们LCMS
  • 麦特绘谱
    麦特绘谱  回复了帖子 请问什么是质控样本,怎么制备,本人第一次接触代谢组学,有好多不是很理解,请教各位大神>o< 371天前
    质控就是把你所有的样本取一部分出来混合以后作为质控样本,质控可用于表征检测数据质量的好坏,以及用于后续的数据矫正。
  • 麦特绘谱
    麦特绘谱  发布了新帖 Cell | 肠道菌群介导生酮饮食的抗癫痫效果 371天前

    当前约有三分之一的癫痫患者属于难治性癫痫,且现有抗癫痫药物疗效并不显著,因此低碳水化合物高脂肪的生酮饮食(Ketogenic diet,KD)成为了有效的治疗方式,但患者难以坚持食谱及不良副作用限制了生酮疗法的应用。深入理解KD抗癫痫的分子机制对于开发临床有效的治疗手段大有裨益。目前研究发现肠道菌群能够调节多个可能与KD抗癫痫相关的代谢和神经通路。KD能够改变小鼠的肠道菌群,而当禁食导致肠道菌群缺乏时,小鼠表现出肝脏生酮作用受损。多项临床研究也已报道抗生素治疗可增加癫痫持续状态或症状性癫痫发作的风险,提示菌群和癫痫间的联系。基于上述已有的研究结果,加州大学洛杉矶分校Elaine Y. Hsiao研究团队提出了“肠道菌群可影响KD抗癫痫效果”的科学假说,并设计了一系列实验进行验证,相关成果发表

  • 麦特绘谱
    麦特绘谱  发布了新帖 Gastroenterology | 支链氨基酸的增加预警胰腺癌风险 382天前

    胰腺癌是美国和日本癌症死亡的主要风险因素,未来几十年全球胰腺癌患者将显著增加。早诊早治是应对胰腺癌高发的有效手段之一,但由于胰腺癌早期症状并不明显,且很少有可用于筛选的方法或生物标记物,大多数患者被确诊时已处于晚期阶段。最近的代谢组学研究结果发现,循环支链氨基酸(BCAAs)即异亮氨酸、亮氨酸和缬氨酸是肥胖、胰岛素抵抗及未来发展成糖尿病的新标志物,BCAAs水平可能会准确地反映肥胖症状态或胰岛素和葡萄糖代谢状况。考虑到肥胖、糖尿病和胰腺癌之间已有的关联,推测BCAAs水平可能与胰腺癌的发生有关。在一项美国成人的前瞻性研究中发现BCAAs水平与未来发展为胰腺癌的风险之间存在明显的正相关关系。Motoki Iwasaki研究团队基于日本公共卫生中心(JPHC)的前瞻性队列,队列I(5个PHC)和

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    麦特绘谱  回复了帖子 代谢组学中的热图是干啥的,代表啥意思? 389天前
    左边这一列是差异物质的名称,横轴是每一个物质在PLS-DA模型的VIP值。右侧代表物质在三组间的相对含量,绿色代表物质在某一组中比其他两组含量高,红色相反表示比其他两组低。
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  • 麦特绘谱
    麦特绘谱  回复了帖子 求助 代谢组学差异代谢物鉴定 420天前
    仪器公司都会有配套的软件。你也可以用免费的软件,液质的可用XCMS-online,气质的可用MS-Dial
  • 麦特绘谱
    麦特绘谱  回复了帖子 请问各位比较代谢组学分析中metabolite enrichment与metabolite abundance有何区别,谢谢 420天前
    b图是比较常用的,就是用fold change和p值来筛选。 c图比较少见,用的是fold change和代谢物的丰度。质谱检测出来样品中的每个代谢物都有一个峰高,最高峰记为100%,其他换算为百分比。它的标准是要大于最高峰的10%,这个比较不常见。
  • 麦特绘谱
    麦特绘谱  回复了帖子 代谢组学数据分析(离子鉴定和通路分析) 420天前
    可以去MetaboAnalyst网站分析,傻瓜式操作。http://dxys.com/FwpyqW
  • 麦特绘谱
    麦特绘谱  回复了帖子 代谢组学中差异权重等值的问题 420天前
    VIP属于多维统计的参数,常结合Corr.Coeffs.对应的p值使用。FC和p值属于单维检验的参数。没有固定标准,都可以用。
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    麦特绘谱  发布了新帖 Nature Medicine | 浅析NAFLD/NASH模型,助您科研无忧! 441天前

    基于临床NAFLD的复杂性,为了更好地阐明疾病的发病机理、寻找潜在治疗靶点、评估单独或联合用药的治疗潜力,临床前有效、安全的体外和体内模型理论研究是必须的。目前NAFLD/NASH研究模型有哪些模型可以进行选择,根据Scott L. Friedman团队发表在Nature Medicine期刊上的《Mechanisms of NAFLD development and therapeutic strategies》进行归纳总结。体外组织工程模型NAFLD的体外模型包括暴露于不同脂质的简单细胞培养以及基于灌注或不灌注模拟血流的3D多细胞组织模型。类似3D培养的层状共培养、球状体、微图案表面、人工精确切割及生物打印等多种方法被用来复制模拟肝脏内完整结构。尽管这些模型大多被运用于候选治疗药物在不同

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    麦特绘谱  发布了新帖 代谢组学粪便样本如何收集 443天前

    今天,小麦要给大家分享一篇有“味道”的推文。俗话说:“病从口入,祸从口出”,小麦曾不以为然。但现如今越来越多有关肠道菌群的研究报道,让小编不禁感叹古人的智慧。这些寄生于人类肠道的微生物几乎和人类所有疾病都有关联。肠道菌群与宿主相互发生代谢作用并产生许多重要的信号因子和代谢底物,如三甲胺-N-氧化物、支链氨基酸、短链脂肪酸和胆汁酸可对诸多疾病的发生发展产生影响。粪便是肠道菌群和宿主互作的终端,具有无创、易于获得特点,常被选择用于菌群相关代谢物的检测。那么对于粪便样本,我们究竟该如何进行采集呢?大鼠粪便收集较为方便,直接取2-3粒,而小鼠粪便小,需要收集≥5粒,收集的新鲜粪便置于灭菌离心管中,再冻存于-80℃冰箱。对于人类粪便样本,面对着一坨散发着异味的排泄物,我们该从何处下手呢?不用担心,已有

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    麦特绘谱  发布了新帖 Nature子刊:“由表及里”论述非酒精性脂肪性肝病 443天前

    据统计全球约有13亿肝病患者,而中国就有4亿之多,占全球肝病患者的30%以上。调查显示我国乙肝患者9600万、丙肝患者1000万、脂肪肝患者2亿、酒精肝患者6000万,其他肝病患者3700万。近年来,以非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)为代表的非感染性肝病的发病率显著上升,其患病率高达15%~40%,已取代病毒性肝病,成为全球第一大肝病,此外酒精性肝病、药物性肝损伤的问题也不容忽视。可见肝病的临床防治工作任重道远,而临床基础研究更是迫在眉睫。非酒精性脂肪性肝病临床现状NAFLD是一类在个体中具有不同临床表现和进展速度的疾病,包括单纯性脂肪肝(NAFL)和进行性非酒精性脂肪性肝炎(NASH)。这种高度可变性反映了环境、微生物组、新陈代谢、合并症和遗传风险影响因素的多样性又表现出趋同的影响。虽然N

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    麦特绘谱  回复了帖子 NSFC | 你所关心的2018国自然中标项目分析:代谢组学与肠道菌群 443天前
    没有哦,只能查到标书的项目名称
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    麦特绘谱  发布了新帖 NSFC | 你所关心的2018国自然中标项目分析:代谢组学与肠道菌群 443天前

    国家自然科学基金榜单公布了,这是让整个中国科研圈都沸腾的事情。我们先来看下整体情况,今年合计41250项项目立项赞助。按项目类型来看,面上项目、青年科学基金项目、部分联合基金项目、重大项目项目数增加较多(如表)。生命科学部21个学科立项6332个项目,共获约31.30亿元,较去年增加0.28亿元。医学科学部共有31个学科共获约42.6亿元,与去年持平,但立项数目(9833个)较去年略有减少。医学科学部项目中获批数量最多前五个学科分别是肿瘤学(1875个)、神经系统和精神疾病(755个)、中医学(655个)、循环系统(594个)、中药学(508个)。肿瘤学科历年来都是热门学科,从资助项目数量来看,一直保持稳中有升的趋势。此外,自2016年以来,国家发布各项中医药相关政策,大力推动中医药产业发展

  • 麦特绘谱
    麦特绘谱  发布了新帖 国自然--代谢组学相关项目回顾分析 823天前

    国家自然科学基金委员会如期公布了今年的项目评审结果,共接收项目申请190840项,经初步审查和复审后共受理187135项,其中经过专家评审和会议审批,最终获得赞助的项目合计40265项,比去年少了1000多项。随着2017年国自然项目的揭晓,笔者作为涉足代谢组学领域十几年的工作人员,最关心的当然是和代谢组学研究相关的项目,在此整理了近十五年来代谢组学及脂质组学获资助的各类项目分布状况(图1、2)以及近五年与代谢组学和脂质组学相关的资助项目数和资助经费情况(图3、4)。从分布图中可见,近十几年国自然基金委在代谢组学和脂质组学研究已持续投入近6亿经费,主要集中在面上项目、青年基金项目及重点项目,但重大项目、国家杰出青年科学基金及优秀青年科学基金项目数量及金额仍不多。*截至发出时,2017年的数据

  • 麦特绘谱
    麦特绘谱  回复了帖子 “绘”聚人才 “谱”写未来——麦特绘谱最新招聘信息! 847天前
    招聘还在进行中!小伙伴们简历投起来!!

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