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  • 莫向外求2018
    莫向外求2018  发布了新帖 冷冻电镜(cryo-EM)三维图像重构 28天前

    冷冻电镜(cryo-EM)三维图像重构软件Relion工作站配置探讨单颗粒冷冻电镜是结构生物学研究的重要手段之一,冷冻电镜的模型重构通常需要对几万甚至几十万张投影图片进行分析、组装和优化,计算量巨大,这需要先进的计算架构配合有效的算法才能实现。 Relion是专门为低温电子显微镜(cryo-EM)设计的图像处理软件。由MRC分子生物学实验室的Sjors Scheres组开发的Relion框架正在革新冷冻电磁领域。该软件在通过电子冷冻显微镜数据的单颗粒分析来优化大分子结构。Relion采用经验贝叶斯方法对多个3D重建或2D类平均值进行细化。借助GPU CUDA并行计算架构,改进了算法,GPU解决了Cryo-EM中计算量最大的过程,例如粒子自动选取,2D和3D图像分类以及高分辨率图像细化。Rel

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