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基因测序的高手请进

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【请教】logistic 回归分析在研究中的应用

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  • ScorpioGirls
    ScorpioGirls  的帖子被加了1分 2小时前

    WGCNA图文详解(五)-GS 与MM的关联

    还是老习惯,给出官网教程,至于你是看还是不看,它就在那里,等着你的深入研究~ https://horvath.genetics.ucla.edu/html/CoexpressionNetwork/Rpackages/WGCNA/Tutorials/ 往期教程:  &n...
  • ScorpioGirls
    ScorpioGirls  回复了帖子 WGCNA图文详解(五)-GS 与MM的关联 4小时前
    加油,要把这个系列写完~
  • ScorpioGirls
    ScorpioGirls  发布了新帖 WGCNA图文详解(五)-GS 与MM的关联 3天前

    还是老习惯,给出官网教程,至于你是看还是不看,它就在那里,等着你的深入研究~ https://horvath.genetics.ucla.edu/html/CoexpressionNetwork/Rpackages/WGCNA/Tutorials/ 往期教程:     (一)WGCNA分析中的软阈值     (二)WGCNA分析中如何选择软阈值?     (三)聚类树Cluster Dendrogram图     (四)Module-trait associations图 WGCNA分析图文详解专题中要解释的第四张图,这张图有点不好

  • ScorpioGirls
    ScorpioGirls  发布了新帖 资料整理--总目录 13天前

    #zhangj#更新时间20190423不要脸的求打赏求收藏求投票!!!【资料整理】-生信基础入门(一)【资料整理】-R包安装镜像设置【资料整理】-R包安装-非常强大的帖子集合【资源整理】-搜索技能篇【小技巧】一次性取多个集合的交集-超好用-R语言【R语言学习】扫盲贴1【TCGA数据库专题】-临床资料里面的那些坑【GEO数据】GEO数据下载非常慢的解决办法

  • ScorpioGirls
    ScorpioGirls  :以后不会再在园子里发帖了,太恶心了使用感。
  • ScorpioGirls
    ScorpioGirls  回复了帖子 深刻解析 |【R语言】究竟是什么? 40天前
    楼主,Rstudio了解一下,哈哈
  • ScorpioGirls
    ScorpioGirls  回复了帖子 cytoscape问题求助 41天前
    目前没有时间呀,有什么问题可以私信交流的~
  • ScorpioGirls
    ScorpioGirls  的帖子被加了1分 42天前

    回复:生物信息版月度风云榜奖励-2019年7月

    id: 湖心 奖励:10丁当
  • ScorpioGirls
    ScorpioGirls  回复了帖子 小鬼的WGCNA图文详解(四)-模块性状相关性 42天前
    多多投票多多支持 哈哈哈 谢啦 这个系列会写很多的 计划把所有教程中的图片都说一遍
  • ScorpioGirls
    ScorpioGirls  回复了帖子 生物信息版月度风云榜奖励-2019年7月 43天前
    id: 湖心奖励:1分
  • ScorpioGirls
    ScorpioGirls  回复了帖子 生物信息版月度风云榜奖励-2019年7月 43天前
    id: 湖心奖励:10丁当
  • ScorpioGirls
    ScorpioGirls  回复了帖子 生物信息版月度风云榜奖励-2019年7月 43天前
    id: 湖心 奖励:10丁当
  • ScorpioGirls
    ScorpioGirls  的帖子被加了1分 43天前

    小鬼的WGCNA图文详解(四)-模块性状相关性

    还是老习惯,给出官网教程,至于你是看还是不看,它就在那里,等着你的深入研究~https://horvath.genetics.ucla.edu/html/CoexpressionNetwork/Rpackages/WGCNA/Tutorials/往期教程:(一)WGCNA分析中的...
  • ScorpioGirls
    ScorpioGirls  发布了新帖 小鬼的WGCNA图文详解(四)-模块性状相关性 43天前

    还是老习惯,给出官网教程,至于你是看还是不看,它就在那里,等着你的深入研究~https://horvath.genetics.ucla.edu/html/CoexpressionNetwork/Rpackages/WGCNA/Tutorials/往期教程:(一)WGCNA分析中的软阈值(二)WGCNA分析中如何选择软阈值?(三)聚类树Cluster Dendrogram图WGCNA分析图文详解专题中要解释的第三张图,所有结果中最主要的结果图恐怕就是这张了:官方注释:Figure 1: Module-trait associations. Each row corresponds to a module eigengene, column to a trait. Each cell 

  • ScorpioGirls
    ScorpioGirls  的帖子被加了1分 48天前

    小鬼的绘图人生三境界《一》

    小编见过太多网上的教程:世人都只教你如何绘图(细心的贴出一堆代码),却不告诉你这幅图作何解释。王国维《人间词话》中提到了人生三境界:古今之成大事业、大学问者,必经过三种之境界:‘昨夜西风凋碧树。独上高楼,望尽天涯路’。此第一境也。‘衣带渐宽终不悔,为伊消得人憔悴。’此第二境也。‘...
  • ScorpioGirls
    ScorpioGirls  发布了新帖 小鬼的绘图人生三境界《一》 48天前

    小编见过太多网上的教程:世人都只教你如何绘图(细心的贴出一堆代码),却不告诉你这幅图作何解释。王国维《人间词话》中提到了人生三境界:古今之成大事业、大学问者,必经过三种之境界:‘昨夜西风凋碧树。独上高楼,望尽天涯路’。此第一境也。‘衣带渐宽终不悔,为伊消得人憔悴。’此第二境也。‘众里寻他千百度,蓦然回首,那人却在,灯火阑珊处’。此第三境也。 小编戏称作图也有三个境界:画,看,归纳总结。画,我们就不说了,网上随便一搜很多帖子很多高手都会教你如何绘制一幅精美的MA图。这里我们今天讲第二个境界:看。以常见的MA图为例进行说明。看图说话应该是小学一开始学习语文时就获得的技能,那么你还记得自己第一篇看图说话的作文是什么么?好了,言归正传,从上面这幅图中你能得到一些什么信息?小编下面来好好给你

  • ScorpioGirls
    ScorpioGirls  的帖子被加了1分 54天前

    回复:生物信息学---差异基因表达分析

    仯杪mm 想请教非癌症类型的疾病相分析差异基因的表达情况该用什么数据库进行分析??对于这句话,我觉得你应该想表达的意思是:1,数据在哪里进行检索?你可能知道TCGA里面存储的数据都是与癌症相关的,所以才会有这样的疑问。其实还有其他的公共数据库比如最常见的GEO(什么疾病类型的数据...
  • ScorpioGirls
    ScorpioGirls  回复了帖子 生物信息学---差异基因表达分析 55天前
    对于这句话,我觉得你应该想表达的意思是:1,数据在哪里进行检索?你可能知道TCGA里面存储的数据都是与癌症相关的,所以才会有这样的疑问。其实还有其他的公共数据库比如最常见的GEO(什么疾病类型的数据都有,非疾病的数据也有,就连搞中药研究的数据也会有你的自己根据关键词去进行检索和筛选),SRA(高通量测序数据,什么类型的数据都有),GDSC(存储细胞系数据),exoRBase(专门存放外泌体数据的,样本好像是正常组织的样本来着)还有针对SNP数据的专门数据库等等有好多数据库,你如果不知道可以谷歌。2,差异分析方法是什么?差异分析方法与数据库没有关系,与样本组织是否为癌症样本也没有关系。与数据类型比如是芯片数据还是测序数据有关,比如常见的二代测序数据使用DEseq,DEseq2,limma,ed
  • ScorpioGirls
    ScorpioGirls  回复了帖子 -20190320更 61天前
    11 链特异性建库的理解
  • ScorpioGirls
    ScorpioGirls  发布了新帖 小鬼的画图专题--总目录 66天前

    #zhangj#业余时间,沉浸在画图中不可自拔#更新时间20190422不要脸的求打赏求收藏求投票!!!【画图专题】火山图Volcano Plot--差异表达分析结果展示系列1【画图专题】barplot--功能富集结果展示之柱状图【画图专题】热图pheatmap()函数【画图专题】pheatmap函数画热图--进阶篇之行注释条【画图专题】热图ComplexHeatmap()函数【画图专题】PCA分析作图【画图专题】venn图【画图专题】小提琴图vioplot【画图专题】cytoscape画图技巧【画图专题】需求征集【画图专题】基因结构序列图GSDS

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