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  • 清林幽
    清林幽  发布了新帖 微生物多样性研究-16S rRNA基因代谢功能预测 29天前

    微生物多样性研究中,16s rRNA基因测序功能预测也常被问及或使用,对于准确度现暂不评价(后期专门单独总结),但对于未做宏基因组的老师算是一个很好的了解功能情况的一个福利。今天总结了16S rRNA基因代谢功能预测方面基本内容和介绍,供大家了解。如下内容,同样整理成了文档,供大家下载保存。下载方式:点击此处进行下载   提取码:jq5d

  • 清林幽
    清林幽  回复了帖子 【原创】内科学(第9版)——人卫第九版2018.7(无水印 带书签 可搜索) 29天前
    楼主,可以用网盘进行分享吗?资料很受用,就是下载比较繁琐,如果需要丁当可以把分享链接放入txt文档中,以附件形式上传会好很多的
  • 清林幽
    清林幽  发布了新帖 微生物多样性研究-关联分析与系统发生进化 30天前

    微生物多样性研究中,还经常使用到关联分析,用于说明物种之间的此消彼长、相互协同等的作用,揭示说明一些功能上的一些变化等。同时,多样性研究中,还涉及到一些进化方面的分析。今天为大家整理了这方面的一些基本情况。希望会有所帮助。如下内容也同时整理成了文档,供大家下载保存。下载方式:点击此处进行下载   提取码:xnkz

  • 清林幽
    清林幽  发布了新帖 微生物多样性研究中的差异分析 33天前

    微生物多样性中的差异分析,往往是用于比较和解释不通样品或样品组之间是否存在差异及其差异的显著情况。今天整理了微生物多样性中的差异分析方面的内容,提供提供给大家。如下内容,同样整理成了文档供大家下载保存。下载方式:点击此处进行下载  提取码:0zk1

  • 清林幽
    清林幽  发布了新帖 微生物多样性-β多样性分析相关内容 34天前

    微生物多样性研究中,β多样性分析常常用于比较不同样品或样品组间的差异情况的。今天整理β多样性分析相关的内容,给出每个分析的主要的解释和诠释的内容,在科研内容解读时会有所帮助。整理的内容,同样汇总成了文档,共大家下载保存。下载方式:点击此处进行下载   提取码:1n04

  • 清林幽
    清林幽  回复了帖子 【16S多样性-样品采集】老鼠粪便样品采集方法(适用于大鼠、小鼠) 35天前
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  • 清林幽
    清林幽  回复了帖子 【微生物多样性-采样】皮肤及鼻腔样本采集方法(From HMP) 35天前
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  • 清林幽
    清林幽  回复了帖子 【二代测序实验技术】细菌16S微生物多样性实验方法介绍及关键点 35天前
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  • 清林幽
    清林幽  回复了帖子 【经验分享-适用于于二代测序等领域】实验样品外送时样品名称命名注意事项 35天前
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  • 清林幽
    清林幽  回复了帖子 【经验分享-二代测序技术】细菌16s rDNA微生物多样性研究中可变区的选择 35天前
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  • 清林幽
    清林幽  发布了新帖 微生物群落深度分析概述 35天前

    今天为整理了微生物群落深度分析方面的概述,供大家参考。主要为了方便理解,这些分析的主要用途和概念,便于应用到自身的科研项目中。如下内容,同样整理成了文档,共大家下载保存使用。下载方式:点击此处进行下载   提取码:er1z 

  • 清林幽
    清林幽  发布了新帖 α多样性指数及其相关分析 40天前

    α多样性指数在微生物多样性研究中,常常指单样品内部微生物的多样性情况和种类分布情况。今天为大家整理了,微生物多样性研究中,α多样性指数及其相关分析的介绍和解释。希望可以帮助到大家。同样,如下内容,已经整体成文档,供大家下载保存使用。下载方式如下:点击此处进行下载  提取码:e464丁香文档下载地址:http://d.mdnews.cn/detail/14638338

  • 清林幽
    清林幽  发布了新帖 OTU聚类与注释 49天前

    微生物多样性研究中,OTU是比较常见名词,那么OTU分析流程及其在微生物多样性研究中处在怎样的位置或具体起到了哪些关键作用,今天为大家整理了微生物多样性研究中OTU聚类及注释的一些内容。如下内容同样整理成了文档,提供给大家下载使用。下载方式:点击此处进行下载  提取码:83ml1. 微生物多样性研究中为何要进行OTU聚类        a)测序完成后,每例样品的测序序列达到几万条,对每一条序列当然都可以进行物种注释,但这种方式工作量大,毕竟每一条序列均需要与数据库进行比对、 比对过程又比较耗时,而且扩增、测序等过程中出现的错误会降低比对结果的准确性。       

  • 清林幽
    清林幽  发布了新帖 ion torrent测序仪测序原理及应用 50天前

    目前,除了illumina测序公司出品的测序仪系列,赛默飞公司同时也拥有一系列ion torrent测序仪(我们常把这类测序仪归属于二代半测序,两者之间测序原理不同)。在测序时间上,ion测序时间往往优于illumina测序仪。测序的方式上,ion系列类似于已经退市的454测序仪,单端测序。在读长上,ion测序仪已经拥有200,400,600,800bp的读长范围,所以在二代测序的应用领域中应用也具有一定潜力。今天为大家总结一下,ion torrent测序仪的测序原理及相关应用方面的内容。同样,如下部分内容已经整理成文档供大家下载。下载方式:点击此处进行下载  提取码:eaod也可通过丁香文档进行下载:http://d.mdnews.cn/detail/14602486

  • 清林幽
    清林幽  发布了新帖 原始数据及其处理方式-illumina测序平台 51天前

    今天为大家整理了一下细菌16S多样性研究中测序数据下机后是怎么处理的,以便于大家理解。如下内容,同样整理成了文档供大家下载使用。下载方式:点击此处进行下载  提取码:9wd9或者通过丁香文档下载://d.dxy.cn/detail/14601656一、主要内容:      1)原始数据的解释及相关概念      2)数据质控      3)原始数据的重要性1.  原始数据的解释及相关概念       原始数据的概念:       a) 测序仪完成测序后生产

  • 清林幽
    清林幽  发布了新帖 Hiseq/Miseq测序原理 56天前

    二代测序技术已经成为一种科研的技术手段,它的测序原理也成是老生常谈。面对着市场上各类测序原理的方法汇总、原理汇总似乎也是一头雾水。今天为大家全面整理了Illumina测序平台测序原理(包含:原理介绍,可逆阻断、SBS、单端测序、双端测序等等方面内容)。希望对大家所有帮助。以下内容,已经整理成了文档,大家可以通过 点击此处进行下载  提取码:jqbv通过附件也可以下载哈。温馨提示,整理好的文档中有视频嵌入,需要电脑中安装flash才能正常播放,所需观看,需要自行安装哈。    

  • 清林幽
    清林幽  发布了新帖 医学微生态学研究方向可投稿杂志汇总-2019年 61天前

    为大家提供一下含医学微生态研究方面的杂志汇总,供大家投稿使用。同样这部分内容也整理成了文档,供大家下载。大家可以通过   点击此处进行下载  提取码:xbx4杂志列表如下:

  • 清林幽
    清林幽  的帖子被加了1分 63天前

    环境微生物多样性研究文献汇总(水体、土壤、空气,2018)

    土壤微生物,小至不可分辨,却群体庞大(1g土壤含数亿个微生物)。它们的种类和数量随成土环境及其土层深度的不同而变化。它们在土壤中进行氧化、硝化、氨化、固氮、硫化等过程,促进土壤有机质的分解和养分的转化。然而,农业的发展伴随而来的土壤污染等问题,也深受关注,如何改善土壤生态,土壤微...

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