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新天回复了帖子 NCBI上可以查看一个基因的拷贝数吗？ 2天前
就是看blast匹配上多少个位置。
新天回复了帖子求助大神，指点perl脚本未初始化错误 100天前
定义了%molHash，但是没有定义%hash？
新天回复了帖子生信perl语言问题 112天前
相关的文件有移动过吧，或者文件路径变了，比如放到其他盘了。
新天回复了帖子用perl探针名转换成基因名 112天前
感觉是因为<STDIN>这个句柄打开的目录路径不对，看下代码19行的位置打开的文件路径
新天回复了帖子知道染色体位置查基因 112天前
如果知道的是序列，就拿这一段序列做blast。如果知道的是位置，就可以用mapview之类的工具，NCBI我知道怎么看，UCSC不知道是否提供这类查询工具。
新天回复了帖子 logFc值很大，甚至有上万的 112天前
Fc值是实验组和对照组的比值，当对照组数值很小，甚至是0的时候，Fc就是无穷大，计算机就给出一个溢出值了。
新天悬赏2丁当求助 183天前
临床资源求助
新天悬赏2丁当求助 183天前
寻求临床调研资源
新天回复了帖子人血做基因芯片和测序哪个比较好 245天前
看实验的目的吧，如果要求精确到高一些就测序，一些低丰度的cfDNA芯片可能杂交不出来。基因比较少直接qPCR也行。还有看自己的预算了。
新天的帖子被加了1分 271天前
回复：求助已证实两个蛋白的相互作用，也知道这两个蛋白的晶体结构，怎么预测分析它们的结合位点？
做预测一般都是找同源蛋白类比。一个蛋白有结晶的话，应该研究比较多，看下其他研究比如其他物种的同源蛋白有没有相关的文献发表。纯计算机模拟不知道杂志接不接受，一般都要有实验结果。
新天回复了帖子请问下，现在市面上有没有一种将扩增检测分析等结合在一个仪器中的基因检测仪器？ 368天前
这个有好几款了。cepheid的genexpert，生物梅里埃的filmarray，罗氏的liat，还有genmark、biocartis、hologic等等几个公司的产品。国内的博晖创新和奥然生物也有，圣湘、天隆也是。
新天回复了帖子为什么我的电脑下载了 ncbi的blast后不能用呢？ 389天前
试一下在cmd界面运行，直接双击bin目录下的exe可能默认程序跑完就自动关闭界面了。
新天回复了帖子关于无突变的PCR讨论 392天前
高保真的酶挺多，建议打电话问下NEB，takara之类的公司，他们会给你推荐的。
新天回复了帖子求助聚类热图中对照组为什么也会有上调和下调 392天前
看下文章是不是以管家基因作为标准的？或者实验时候加了标准品什么的？
新天回复了帖子 CCLE网站数据整理得到的图片，protein array数据是什么意思，能否代表该蛋白质的表达情况，为什么会有负数 439天前
点阵的数据是log过的，应该是取了2为底的对数，所以原始数小于1都是负数。还有就是表达量一般是相对的，所以原始数据有可能也是一个比值，即实验组/对照组，大于1就是上调，小于1是下调（这个我猜的，因为好多网站都这么表示，不知道你这个是不是）。
新天回复了帖子大神，这道题用perl怎么做 439天前
@seq=split " ", $_;print OUT ">@seq[0]\n@seq[1]\n";
新天回复了帖子有没有什么办法可以直接把加了酶切位点的PCR产物，直接连接到载体上啊 439天前
当初用的gateway的重组连接系统。就是死贵死贵的。
新天回复了帖子一代测序测序原理疑问 439天前
一代测序的常规扩增步骤和测序扩增步骤是分开做的。先是常规的PCR扩增，用双引物，容易理解。常规扩增之后要纯化，然后再做测序扩增。测序扩增是只用一条引物的，上游引物或者下游引物中的一条，所以是单方向的，用那条引物就往哪个方向。
新天回复了帖子有基因组序列，和别的植物中的基因序列，在基因组中找他的同源序列 443天前
到NCBI下载一个local Blast，把目标基因组做成数据库，再用你的序列比对一下就出来了
新天回复了帖子求助已证实两个蛋白的相互作用，也知道这两个蛋白的晶体结构，怎么预测分析它们的结合位点？ 513天前
做预测一般都是找同源蛋白类比。一个蛋白有结晶的话，应该研究比较多，看下其他研究比如其他物种的同源蛋白有没有相关的文献发表。纯计算机模拟不知道杂志接不接受，一般都要有实验结果。

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