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丁香客

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  • 二十一业
    二十一业  回复了帖子 细菌MLST分型 5天前
    来找我呀
  • 二十一业
    二十一业  的帖子被加了1分 10天前

    回复:菌名疑问

    这三个可能没有很特殊的含义,只是菌株所有者自己设定的,前面是种属名,后面给这株菌取了个名字。举个例子,物种“人”,然后给这个人取了个名字,叫“xxx”
  • 二十一业
    二十一业  回复了帖子 请问Cephalotheca foveolata这个真菌的中文名字是什么? 11天前
    不知道,也没找到用的比较多的中文名。那么恭喜你,可以根据这个菌的拉丁命名的解释,自己尝试做一下“翻译”吧,为这个菌赋予一个中文名
  • 二十一业
    二十一业  回复了帖子 菌名疑问 11天前
    这三个可能没有很特殊的含义,只是菌株所有者自己设定的,前面是种属名,后面给这株菌取了个名字。举个例子,物种“人”,然后给这个人取了个名字,叫“xxx”
  • 二十一业
    二十一业  回复了帖子 如何从霍乱弧菌的基因组重测序结果得到该菌的血清型? 15天前
    或许我可以帮你看看
  • 二十一业
  • 二十一业
    二十一业  回复了帖子 关于菌液测序结果的问题 31天前
    这种用二代测序还是比较方便的,可以试试。
  • 二十一业
    二十一业  回复了帖子 关于16s种属鉴定的问题 42天前
    可能原因:1、菌不纯。单侧套峰或者双侧套峰都有可能。2、菌是纯的,有多拷贝16S rDNA序列,并且序列不完全相同。3、测序的小概率出错。4、扩增实验的小概率出错。解决方法:1、重新分单菌落,然后扩增测序,看是否还是套峰。2、不行就直接测个框架图。
  • 二十一业
    二十一业  的帖子被加了1分 53天前

    回复:测序公司坑吗

    多样性测序,如果用的扩增子测序流程,那么“空白样本”,也是有可能扩增出来东西的,因为所谓的“空白”不一定真的空白,而且整个流程的任何一步操作或者试剂都有可能引入污染
  • 二十一业
    二十一业  回复了帖子 鲍曼不动杆菌MLST分型问题 54天前
    测基因组吧
  • 二十一业
    二十一业  回复了帖子 求助,噬菌体基因组怎么测? 54天前
    私聊我呀,已经测了N多噬菌体了
  • 二十一业
    二十一业  回复了帖子 跪求不需要测序原始数据上传的期刊 55天前
    重新测吧
  • 二十一业
    二十一业  回复了帖子 高通量测序的原始数据要上传吗? 55天前
    国内也有维护的数据库,如果杂志没有指定数据库的话,国内数据库上传是比较方便的,主要是沟通方便
  • 二十一业
    二十一业  回复了帖子 测序公司坑吗 55天前
    多样性测序,如果用的扩增子测序流程,那么“空白样本”,也是有可能扩增出来东西的,因为所谓的“空白”不一定真的空白,而且整个流程的任何一步操作或者试剂都有可能引入污染
  • 二十一业
    二十一业  回复了帖子 求助PFGE数据分析 55天前
    我有资源
  • 二十一业
    二十一业  回复了帖子 寻求脉冲场凝胶电泳实验服务公司 130天前
    在分型的应用上,PFGE是时代产物,试剂成本几十块,服务价小几百块,正逐步被WGS淘汰,不过完全淘汰还需要几年的吧。 WGS细菌分型,一般而言,草图完全够用了,全球的细菌流行病学监测,目前和未来很长一段时间,都会用草图,除非测序技术发展到完成图也很便宜了才可能用完成图去做分型了。
  • 二十一业
    二十一业  回复了帖子 铜绿假单胞菌MLST分型问题 140天前
    直接测二代,几百块钱,贵不了多少钱……
  • 二十一业
    二十一业  的帖子被加了1分 153天前

    回复:高毒力肺克DNA的提取

    我猜,你说的高质量是要满足几个要求:1、纯度高,比如没有RNA污染,没有蛋白等大分子污染。 解决方法:提取过程需要加入酶消化,比如蛋白酶K,RNA消化酶等。 2、浓度高或者说总量高。 解决方法:增大菌液用量。 3、DNA的完整性高。 根据不同的下游实验目的,对DNA完整性的要求不...
  • 二十一业
    二十一业  的帖子被加了1分 153天前

    回复:细菌鉴定生化结果和测序结果不一致

    1、如@咖啡_加糖所言,16S rDNA鉴定种都不一定可靠,鉴定亚种就更别想了。 2、要看亚种是如何定义的,根据亚种的定义,选择定义所说的鉴定方法去判断亚种。比如有些是根据血清型判断的,有些是根据基因型判断的。 3、你够买的菌株,都有特定的编号以及说明,菌种保藏中心的工...
  • 二十一业
    二十一业  回复了帖子 高毒力肺克DNA的提取 164天前
    我猜,你说的高质量是要满足几个要求:1、纯度高,比如没有RNA污染,没有蛋白等大分子污染。 解决方法:提取过程需要加入酶消化,比如蛋白酶K,RNA消化酶等。 2、浓度高或者说总量高。 解决方法:增大菌液用量。 3、DNA的完整性高。 根据不同的下游实验目的,对DNA完整性的要求不一样。 比如完整性要求从低到高:普通PCR实验<短读长二代测序<长度长二代测序≤三代测序≤光学图谱测序 肺克最多要上三代测序,所以基本上都能用柱提法解决。需要在DNA提取实验的操作过程足够的规范,精细和熟练。

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